При Харьковском энтомологического общества работает собственная библиотека научной и научно-популярной литературы. Ее фонды содержат подшивки 75 научных журналов по энтомологии, экологии и арахнологии, почти все тома «Фауны Украины», «Фауны СССР», «Определитель насекомых европейской части СССР», «Определитель насекомых Дальнего Востока СССР» и более 260 монографий, посвященных отдельным группам насекомых и другим беспозвоночным.
Кроме того, в библиотеке хранятся многочисленные публикации о сетчатокрылых насекомых (монографии и статьи), которые были собраны в свое время Александром Всеволодовичем Захаренко, известным специалистом по этой группы насекомых и бывшим председателем ХЭО (1989-2004).
В общем библиотека содержит более 4500 наименований. Она доступна в помещении, которое закреплено за ХЭО Приказом ректора Харьковского национального университета имени В. Н. Каразина.